Deoksyribose er et 5-karbon monosakkarid (pentose) som dannes fra ribose når det mister ett oksygenatom. Den empiriske kjemiske formelen for deoksyribose er C5H10O4, og på grunn av tap av en oksygenatom, stemmer det ikke med den generelle formelen for monosakkarider (CH2O) , der n er et heltall.
Fysiske og kjemiske egenskaper
Den lineære formelen for deoksyribose kan representeres som følger: H-(C=O)–(CH2)–(CHOH)3-H. Imidlertid eksisterer den også i form av en lukket ring av karbonatomer.
Deoksyribose er et fargeløst fast stoff som er luktfritt og svært løselig i vann. Molekylvekten er 134,13 g/mol, smeltepunkt 91 °C. Det er oppnådd fra ribose-5-fosfat på grunn av virkningen av passende enzymer under den kjemiske reduksjonsreaksjonen.
Forskjellen mellom ribose og deoksyribose
Som allerede nevnt og som navnet antyder, er deoksyribose en kjemisk forbindelse hvis atomsammensetning skiller seg fra ribose med bare ett oksygenatom. Som visti figuren nedenfor har ikke deoksyribose en OH-hydroksylgruppe på sitt andre karbonatom.
Deoksyribose er en del av DNA-kjeden (deoksyribonukleinsyre), mens ribose er en del av RNA-kjeden (ribonukleinsyre).
Det er interessant å merke seg at monosakkaridene arabinose og ribose er stereoisomerer, det vil si at de er forskjellige i romlig arrangement i forhold til planet til OH-grupperingen nær det andre karbonatomet. Deoksyarabinose og deoksyribose er den samme forbindelsen, men det andre navnet brukes fordi dette molekylet er avledet fra ribose.
Deoksyribose og genetisk informasjon
Fordi deoksyribose er en del av DNA-kjeden, spiller det en viktig biologisk rolle. DNA - kilden til genetisk informasjon, består av nukleotider, som inkluderer deoksyribose. Deoksyribosemolekyler knytter ett nukleotid til et annet i DNA-kjeden gjennom fosfatgrupper.
Fraværet av hydroksyl-OH-gruppen i deoksyribose har vist seg å gi mekanisk fleksibilitet til hele DNA-kjeden sammenlignet med RNA, som igjen lar DNA-molekylet danne en dobbelttråd og være i en kompakt form inne i cellekjerne.
I tillegg, på grunn av fleksibiliteten til bindinger mellom nukleotider dannet av deoksyribosemolekyler og fosfatgrupper, er DNA-kjeden mye lengre enn RNA. Dette faktum gjør det mulig å kode genetisk informasjon med høy tetthet.